1、采用厌氧发酵：与好氧发酵相比，厌氧发酵方式是最安全的，因为厌氧可大大抑制好氧性霉菌、腐败菌的生长，从而防止霉菌毒素的产生，保证饲料的安全。
2、选择高品质的发酵剂：发酵饲料是利用发酵剂中的微生物繁殖、代谢等活动来实现饲料中物质的转变的（有害物质的减少，有益物质的增加），发酵剂中微生物在饲料中繁殖迅速，几天内就会增殖几千倍到上万倍，因此如果发酵剂出现任何一点杂菌污染，都足以放大到成千上万吨饲料的污染。因此，所选用的发酵剂必须是经过严格菌株筛选、纯度达标的制剂。
3、严格控制发酵条件：由于自制发酵池在室外，受自然环境影响较大，温度不易人为控制，但仍需尽量选择气温在20度以上进行。发酵饲料的水分也要严格把关，不能过稀也不能过干，一般控制水分为40%-50%为宜。每次发酵前要对发酵池进行消毒处理，保证发酵池的卫生、干净。
4、发酵料放置时间不宜过长：发酵料放置时间越短越好，一般不要超过15天，以防止霉变。
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